Werner Günthör (född 1 juni1961 i Uttwil, Schweiz) är en före detta schweizisk kulstötare i friidrott. Günthörs storhetstid var i slutet av 1980-talet och början av 1990-talet. Bland annat vann han tre raka VM-guld under åren 1987-1993.
1986: EM-guld i Stuttgart (22,22 meter) och EM-guld inomhus i Madrid (21,74 meter).
1987: VM-guld i Rom (22,23 meter), VM-silver inomhus i Indianapolis (21,61 meter) efter Ulf Timmermann (22,24 meter) och EM-silver inomhus i Lievin (21,53 meter) efter Ulf Timmermann (22,19 meter).
1991: VM-guld i Tokyo (21,67 meter) och VM-guld inomhus i Sevilla (21,17 meter).
1993: VM-guld i Stuttgart (21,97 meter).
Personligt rekord
Günthör personliga rekord är 22,75 meter från en tävling i Bern, Schweiz, den 23 augusti1988 vilket placerar honom på femte plats genom idrottshistorien (oktober 2008) [1].
Efter friidrottskarriären
Den 2,00 meter långe Günthör tävlade efter friidrottskarriären i bob. Idag jobbar han som idrottslärare och friidrottscoach. Han är gift och bor i Biel, Schweiz.