Limosilactobacillus

Limosilactobacillus reuteri
Systematik
DomänBakterier
StamFirmicutes
OrdningLactobacillales
FamiljLactobacillaceae
SläkteLimosilactobacillus

Limosilactobacillus är ett släkte av mjölksyrabakterier, som tillkom 2020 som en utbrytning från släktet Lactobacillus.[1] [2] Namnet kommer från "limosus" på latin, som betyder "slemmig" och har att göra med att flertalet arter inom släktet producerar exopolysackarider av sackaros.[3][2] Släktet består idag av 31 arter eller underarter, varav de flesta isolerats från mag- och tarmkanalen hos människor och andra djurarter.

Limosilactobacilli är heterofermativt, det vill säga att det producer två eller fler produkter samtidigt vid fermentation. Det producerar laktat, koldioxid och acetat eller etanol av glykos. Många arter, särskilt underarter av Lm. reuteri omvandlar glycerol eller 1,2-propandiol till 1,3-propandiol respektive propanol.[4] Flertalet underarter tillväxer inte vid närvaro av syre, eller i de Man, Rogosa Sharpe-agar (MRS), som är standardmedium för att odla lactobaciller. Det räcker vanligtvis med att lägga till maltos, cystein och fruktos till MRS för att odla limosilactobaciller.

Arten Limosilactobacillus reuteri har används som en modellorganism vid forskning om värddjurs anpassning av mjölksyrabakterier till sina kroppar.[5] [6] och för att välja ut mag- och tarm-mjölksyrebakterier för fermentering av livsmedel.[7] [8]

Arter

Släktet Limosilactobacillus består av nedanstående arter:[9]

  • Limosilactobacillus agrestis Li et al. 2021
  • Limosilactobacillus albertensis Li et al. 2021
  • Limosilactobacillus alvi Zheng et al. 2020
  • Limosilactobacillus antri (Roos et al. 2005) Zheng et al. 2020
  • Limosilactobacillus balticus Li et al. 2021
  • Limosilactobacillus caviae (Killer et al. 2017) Zheng et al. 2020
  • Limosilactobacillus coleohominis (Nikolaitchouk et al. 2001) Zheng et al. 2020
  • Limosilactobacillus equigenerosi (Endo et al. 2008) Zheng et al. 2020
  • Limosilactobacillus fastidiosus Li et al. 2021
  • Limosilactobacillus fermentum (Beijerinck 1901) Zheng et al. 2020
  • Limosilactobacillus frumenti (Müller et al. 2000) Zheng et al. 2020
  • Limosilactobacillus gastricus (Roos et al. 2005) Zheng et al. 2020
  • Limosilactobacillus gorillae (Tsuchida et al. 2014) Zheng et al. 2020
  • Limosilactobacillus ingluviei (Baele et al. 2003) Zheng et al. 2020
  • Limosilactobacillus mucosae (Roos et al. 2000) Zheng et al. 2020
  • Limosilactobacillus oris (Farrow and Collins 1988) Zheng et al. 2020
  • Limosilactobacillus panis (Wiese et al. 1996) Zheng et al. 2020
  • Limosilactobacillus pontis (Vogel et al. 1994) Zheng et al. 2020
  • Limosilactobacillus portuensis Ksiezarek et al. 2021
  • Limosilactobacillus reuteri (Kandler et al. 1982) Zheng et al. 2020
  • Limosilactobacillus rudii Li et al. 2021
  • Limosilactobacillus secaliphilus (Ehrmann et al. 2007) Zheng et al. 2020
  • Limosilactobacillus urinaemulieris Ksiezarek et al. 2021
  • Limosilactobacillus vaginalis (Embley et al. 1989) Zheng et al. 2020

Fylogeni

Nuvarande accepterad taxonomi baseras på List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature[9] och fylogenin är baserad på hela genomsekvenser.[2]


Limosilactobacillus







Limosilactobacillus antri



Limosilactobacillus oris




Limosilactobacillus panis





Limosilactobacillus frumenti



Limosilactobacillus vaginalis





Limosilactobacillus pontis





Limosilactobacillus caviae



Limosilactobacillus reuteri







Limosilactobacillus ingluviei



Limosilactobacillus alvi





Limosilactobacillus coleohominis



Limosilactobacillus secaliphilus







Limosilactobacillus mucosae





Limosilactobacillus equigenerosi



Limosilactobacillus gastricus





Limosilactobacillus gorillae



Limosilactobacillus fermentum






utgrupp

Holzapfelia



Referenser

Denna artikel är baserad på artikeln Limosilactobacillus på engelskspråkiga Wikipedia.

Noter

  1. ^ The Lactobacillus taxonomy change has arrived! What do you need to know? på www.microbiometimes.com den 21 april 2020
  2. ^ [a b c] Zheng, Jinshui; Wittouck, Stijn; Salvetti, Elisa; Franz, Charles M.A.P.; Harris, Hugh M.B.; Mattarelli, Paola; O’Toole, Paul W.; Pot, Bruno; et al. (2020). ”A taxonomic note on the genus Lactobacillus: Description of 23 novel genera, emended description of the genus Lactobacillus Beijerinck 1901, and union of Lactobacillaceae and Leuconostocaceae”. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 70 (4): sid. 2782–2858. doi:10.1099/ijsem.0.004107. ISSN 1466-5026. PMID 32293557. 
  3. ^ Li, Xiaodan; Wang, Xiaofei; Meng, Xiangfeng; Dijkhuizen, Lubbert; Liu, Weifeng (2020-12-01). ”Structures, physico-chemical properties, production and (potential) applications of sucrose-derived α-d-glucans synthesized by glucansucrases” (på engelska). Carbohydrate Polymers 249: sid. 116818. doi:10.1016/j.carbpol.2020.116818. ISSN 0144-8617. PMID 32933666. https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S0144861720309917. 
  4. ^ Gänzle, Michael G. (2015-04-01). ”Lactic metabolism revisited: metabolism of lactic acid bacteria in food fermentations and food spoilage” (på engelska). Current Opinion in Food Science 2: sid. 106–117. doi:10.1016/j.cofs.2015.03.001. ISSN 2214-7993. https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S2214799315000508. 
  5. ^ Frese, Steven A.; Benson, Andrew K.; Tannock, Gerald W.; Loach, Diane M.; Kim, Jaehyoung; Zhang, Min; Oh, Phaik Lyn; Heng, Nicholas C. K.; et al. (2011-02-17). ”The Evolution of Host Specialization in the Vertebrate Gut Symbiont Lactobacillus reuteri”. PLOS Genetics 7 (2): sid. e1001314. doi:10.1371/journal.pgen.1001314. ISSN 1553-7404. PMID 21379339. PMC: 3040671. https://journals.plos.org/plosgenetics/article?id=10.1371/journal.pgen.1001314. 
  6. ^ Duar, Rebbeca M.; Frese, Steven A.; Lin, Xiaoxi B.; Fernando, Samodha C.; Burkey, Thomas E.; Tasseva, Guergana; Peterson, Daniel A.; Blom, Jochen; et al. (2017). ”Experimental Evaluation of Host Adaptation of Lactobacillus reuteri to Different Vertebrate Species”. Applied and Environmental Microbiology 83 (12). doi:10.1128/aem.00132-17. PMID 28389535. PMC: 5452824. https://journals.asm.org/doi/abs/10.1128/AEM.00132-17. Läst 13 augusti 2021. 
  7. ^ Zheng, Jinshui; Zhao, Xin; Lin, Xiaoxi B.; Gänzle, Michael (2015-12-11). ”Comparative genomics Lactobacillus reuteri from sourdough reveals adaptation of an intestinal symbiont to food fermentations”. Scientific Reports 5 (1): sid. 18234. doi:10.1038/srep18234. ISSN 2045-2322. PMID 26658825. Bibcode: 2015NatSR...518234Z. 
  8. ^ Li, Qing; Gänzle, Michael G. (2020-02-01). ”Host-adapted lactobacilli in food fermentations: impact of metabolic traits of host adapted lactobacilli on food quality and human health” (på engelska). Current Opinion in Food Science 31: sid. 71–80. doi:10.1016/j.cofs.2020.02.002. ISSN 2214-7993. https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S2214799320300138. 
  9. ^ [a b] ”Acetilactobacillus”. Acetilactobacillus. List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN). https://lpsn.dsmz.de/genus/acetilactobacillus.